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NBDC グループ共有データベース

現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所(NIG)バイオデータ研究拠点(BSI)ライフサイエンス統合データベース部門(DBCLS)」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

AGD データの提供

AMED ゲノム制限共有データベース(AGD)にヒトに関するデータ(遺伝情報、臨床情報、画像情報など)を提供するには、データ提供申請が必要です。申請は AGD 申請システムで行います。ヒトデータ審査委員会が申請を審査し、承認された後に AGD へデータを登録します。

#データ提供申請に向けた事前準備

  • 次のガイドラインの最新版を熟読し、権利や責務を確認してください。
  • データ提供申請に必要な次の情報を準備してください。
    • 提供するデータに関する情報
      • 研究内容の概要:目的、方法、対象など
      • データの種類:名称・量、アクセス制限レベルの分類に関する情報など
    • 研究代表者の氏名、所属情報(所属機関名、職名、所在地)、連絡先(電話番号、メールアドレス)
    • 所属機関の長の氏名、職名、連絡先。所属機関の長とは、倫理審査委員会によって承認された研究計画の実施を許可する者を指します。
    • 提供するデータを産出した際の研究計画書(倫理審査申請書)
    • インフォームドコンセントの際の説明文書および同意文書のフォーム(書式)。署名されたものではなく、フォームを提出してください。
    • 所属機関等の倫理審査委員会の審査・承認を受けた上で、所属機関の長が研究実施について許可したことが分かる書面(承認通知書など)の写し
  • AGD 申請システムにログインするための準備をしてください。
    • 研究代表者、研究代表者が指名した申請者(研究代表者に代わってデータ提供申請の手続きをする者)、データアップロード担当者の DDBJ アカウントが必要です。所属機関の長のアカウントは不要です。
    • 申請には、日本語表記の氏名、電話番号、職名などの情報が必要です。DDBJ アカウントに登録してください。
    • DDBJ アカウントの登録内容が AGD 申請システムに反映されるまで、10 分程度かかります。
明らかに『人を対象とする生命科学・医学系研究に関する倫理指針』の対象にならないヒト由来試料からのデータ(既に学術的な価値が定まり、研究用として広く利用され、かつ、一般に入手可能な試料・情報)を提供する場合は、研究代表者の署名済みの『データ提供申請簡易審査希望届』(自由書式、例)を、所属機関の長による研究実施許可書(承認通知書など)の代わりにできます。

#データ提供の流れ

  1. AGD 申請システム(推奨ブラウザ:Chrome、Firefox)に DDBJ アカウントでログインします。
  2. データ提供申請グループを作成します。画面左側のメニューの[グループ作成]で、グループ名、グループの説明、グループ種別『データ提供申請グループ』を入力して保存します。
  3. [メンバタブ]の[メンバを招待する]で、研究代表者、申請者、データアップロード担当者を、所属機関が発行したメールアドレスか DDBJ アカウントで招待します。招待されたメンバが招待を許可すると、グループのメンバになります。
  4. データ提供申請の代表者を、グループの PI にします。代表者がグループを作成した場合は、既に PI/Owner なので変更は不要です。
  5. [データ提供申請を行う]を押します。提供申請一覧の上で言語を選び(日本で研究活動をする研究者は、原則として日本語を選んでください)、[新規申請を開始する]を押すと、申請の入力フォームが開きます。
  6. データ提供申請グループを選びます。グループに登録されている研究代表者と申請者の情報は自動で入力されます。修正が必要なときは、データ提供申請グループの登録情報を修正してください。
  7. 申請フォームに沿って必要事項を入力し、必要書類を添付して、申請ボタンを押します。
    • 所属機関の長:倫理審査委員会によって承認された研究計画の実施を許可する者です。審査結果通知書などに記載された所属機関の長の情報を入力してください。
    • データを提供する研究題目:倫理審査委員会による承認と所属機関の長による許可を受けた研究計画書に記載された題目を入力してください。
    • 研究計画書(倫理審査申請書)、インフォームドコンセントの説明文書・同意文書、承認通知書などを添付するときは、file type を指定してください。1 つのファイルに複数の file type を指定できます。
    • アクセスレベルの異なるデータ(非制限公開、制限公開)を 1 回の申請で申請できます。
  8. 審査の結果は、データ提供申請グループ宛のメールで通知します。必要な書面がそろってから 2 週間程度で通知しますが、繁忙期や祝日などで遅くなることがあります。
  9. 承認された場合は、データのアップロード方法と専用サイト(案)の確認依頼について、ヒトデータ審査委員会事務局から連絡します。

#提供申請承認後の手続き

#データの差し替えや追加

既に提供しているデータと同じポリシーのデータ(同じインフォームドコンセントの説明文書や同意文書、研究計画書に由来するデータ)を差し替える・追加するときは、提供データ更新申請をしてください。ポリシーが異なるデータは、新しいデータ提供申請になります。

  1. AGD 申請システムのデータ提供申請一覧で、当初のデータ提供申請で発番された[A-DS 番号]を押して詳細画面を開きます。
  2. セレクトボックスから[提供データ更新申請]を選び、申請書を作成して申請します。
  3. 更新・追加するファイルの詳細一覧に記入して添付してください。1 ファイルにつき 1 行で記入します。データ追加の場合は B・E・F・H~K 列が、差し替えの場合はそれに加えて G・L 列が必須です。
  4. 研究計画書などの倫理関係書類が更新されているときは、併せて添付してください。

#アクセッション番号の発行と公開系データベースへの移行

投稿論文などに引用できるアクセッション番号の発行を希望するとき、または一定期間の後に NBDCヒトデータベース(公開系データベース)へデータを移行するときは、NBDCグループ共有データ移行申請書に記入し、メールでヒトデータ審査委員会事務局に送付してください。

#注意事項

  • 提供申請の内容の一部(データ概要)は、データの登録が終わった後に、AGD の各研究のページで公開されます。掲載する内容は、AGD 研究一覧と各研究のページをご覧ください。
  • AGD へのデータ登録の際に発行される AGD 整理番号(例:AGDS_6 桁の数字、AGDD_6 桁の数字)は、論文などに引用できません。