AGD データの利用

AMED ゲノム制限共有データベース（AGD）のデータを利用するには、データ利用申請が必要です。申請の前に、利用するデータを提供したデータ提供者から、データの利用について承諾を受けてください。申請は AGD 申請システムで行います。ヒトデータ審査委員会が申請を審査し、承認された後にデータへのアクセス権が付与されます。

#データ利用申請に向けた事前準備

次のガイドラインの最新版を熟読し、権利や責務、利用者要件を確認してください。
- NBDCヒトデータグループ共有ガイドラインと、AGD の別表
- NBDCヒトデータグループ共有データ取扱いセキュリティガイドライン（データ利用者向け）
AGD データセット一覧と AGD 研究一覧で利用したいデータセットを選び、データセット ID を控えてください。1 回の申請で、複数のデータセットを申請できます。
- データセットごとの利用者要件（制限事項に記載されているポリシーの内容）に合致するか確認してください。
- データセットのアクセス制限レベル（Type I または Type II）を確認し、必要なセキュリティ対策を実施してください。
利用するデータを提供したデータ提供者から、データの利用について承諾を受けてください。承諾を受けたことが分かる書類は、データ利用申請に添付します。
NBDCヒトデータグループ共有データ取扱いセキュリティガイドラインチェックリストをダウンロードし、セキュリティ対策の実施状況を記載してください。
データの保管・解析に機関外サーバの利用を予定している場合は、機関外サーバ運用機関のサイトで公開されているセキュリティチェックリスト（機関外サーバ運用責任者向け）を入手し、その機関外サーバが NBDCヒトデータグループ共有データ取扱いセキュリティガイドラインを満たしていることを確認してください。
データ利用申請に必要な次の情報を準備してください。同一機関に所属する研究分担者と受託者は、1 回の申請で登録できます。
- 研究代表者およびデータ利用を希望する研究分担者全員の情報：氏名、職名、メールアドレス、研究者 ID、倫理講習受講の有無
- 解析等の受託先がある場合は受託者の情報：所属機関、決まっている場合は担当者名・職名・メールアドレス・研究者 ID・倫理講習受講の有無
- 所属機関の長の氏名、職名、メールアドレス。所属機関の長とは、倫理審査委員会によって承認された研究計画の実施を許可する者を指します。
- 取得したデータを使用する研究の研究計画書（倫理審査申請書など）
- 所属機関等の倫理審査委員会の審査・承認を受けた上で、所属機関の長が研究実施について許可したことが分かる書面（承認通知書など）の写し
AGD 申請システムにログインするための準備をしてください。
- 研究代表者、研究分担者のうち研究代表者が指名した申請者（研究代表者に代わってデータ利用申請の手続きをする者）、データダウンロード担当者の DDBJ アカウントが必要です。所属機関の長のアカウントは不要です。
- 申請には、日本語表記の氏名、電話番号、職名などの情報が必要です。DDBJ アカウントに登録してください。
- DDBJ アカウントの登録内容が AGD 申請システムに反映されるまで、10 分程度かかります。
利用を許可されたデータセットの転送に使う『データセット暗号化用公開鍵・秘密鍵』を作成してください（作成方法、作成手順の動画）。『公開鍵』は、データ利用申請の際に登録します。

#データ利用の流れ

AGD 申請システム（推奨ブラウザ：Chrome、Firefox）に DDBJ アカウントでログインします。
データ利用申請グループを作成します。画面左側のメニューの［グループ作成］で、グループ名、グループの説明、グループ種別『データ利用申請グループ』を入力して保存します。
［メンバタブ］の［メンバを招待する］で、同一機関に所属する研究者を招待します。グループには『データ利用申請の際の代表者』『申請作業代表者』『データダウンロード担当者』を必ず含めてください。DDBJ アカウントを持っていないメンバは、所属機関が発行したメールアドレスで招待します。招待されたメンバが招待を許可すると、グループのメンバになります。
データ利用申請の代表者を、グループの PI にします。代表者がグループを作成した場合は、既に PI/Owner なので変更は不要です。
［データ利用申請を行う］を押します。利用申請一覧の上で言語を選び（日本で研究活動をする研究者は、原則として日本語を選んでください）、［新規申請を開始する］を押すと、申請の入力フォームが開きます。
データ利用申請グループを選びます。グループに登録されている研究代表者と研究分担者の情報は自動で入力されます。修正が必要なときは、データ利用申請グループの登録情報を修正してください。『データ利用申請の際の代表者』『申請作業代表者』『データダウンロード担当者』に該当しない研究分担者は、『その他の研究分担者』に記載してください。
申請フォームに沿って必要事項を入力し、必要書類を添付して、申請ボタンを押します。
- 所属機関の長：倫理審査委員会によって承認された研究計画の実施を許可する者です。審査結果通知書などに記載された所属機関の長の情報を入力してください。
- データを利用する研究題目：倫理審査委員会による承認と所属機関の長による許可を受けた研究計画書に記載された題目を入力してください。
- 研究計画書（倫理審査申請書）、承認通知書、セキュリティガイドラインチェックリスト、データ提供者の承諾を受けたことが分かる書類などを添付するときは、file type を指定してください。1 つのファイルに複数の file type を指定できます。
審査の結果は、データ利用申請グループ宛のメールで通知します。審査に必要な書面がそろってから 2 週間程度で通知しますが、繁忙期や祝日などで遅くなることがあります。
承認された場合は、データへのアクセス権が付与されます。AGD 利用手順に従って、データにアクセスしてください。

#利用申請承認後の各種手続き

次の手続きは、AGD 申請システムのデータ利用申請一覧で該当する［A-DU 番号］を押して詳細画面を開き、［申請開始］ボタンの左側のセレクトボックスから申請の種類を選んで、申請書を作成・申請します。

年次報告：データ利用期間が複数年にわたる場合は、1 年ごとにデータの利用状況とセキュリティ環境の報告が必要です。［データ利用報告申請］を選んでください。報告が遅れた場合、データを利用できなくなることがあります。
データ利用期間の延長：当該データのデータ提供者に確認した上で、データ利用期間が満了する 1 か月前までに［データ利用期間延長申請］を選んで申請してください。所属機関の長から許可されている研究期間が分かる書類を添付してください。
データセットの追加：当該データのデータ提供者に確認した上で、［利用データセット追加申請］を選んで申請してください。
データ利用の終了：データの利用状況とデータの破棄状況を報告するため、［データ利用終了申請］を選んで申請してください。データを利用して生じた集計・統計解析結果などの二次データの保管を希望する場合は、データ保管申請をしてください。

所属機関が変わるときは、早めにヒトデータ審査委員会事務局へ連絡してください。研究を続けるには、新しい所属機関の長による研究実施許可と、新しい所属機関からのデータ利用申請が必要です。

#注意事項

データ提供者や試料・情報提供者からの申し出などにより、データ利用の承認が取り消される場合があります。
既に利用しているデータを、明白に異なる別の研究に利用する場合は、改めてデータ利用申請が必要です。
AGD 番号（例：AGDS_6 桁の数字、AGDD_6 桁の数字）は、論文などに引用できません。AGD を介して取得したデータを含む解析結果を投稿論文などで発表するときは、取得したデータが公的データベースへ移行され、引用できるアクセッション番号が発行されている必要があります。当該データの提供者に確認してください。