データセット ID
AGDD_000025
- データの種類
- メタボローム
- アクセス制限
- Type I
- 総データ量
- 5.0 TB
- ファイル形式
- mzML
- TXT
- CSV
- XLSX
- 研究
- agd0029
- 公開日
- 2023-09-11
- 更新日
- 2026-11-05
- AGD Study
- AGDS_000016
解析手法
メタボローム
- 試料 / 対象者
- 糖尿病（ICD10：E10-E14）：200症例
入退院時の糞便ライセート：400検体 - 健康状態罹患
- 対象者数200 (人数)
- 疾患
- 糖尿病
- 試料説明
- 糞便ライセート
- 組織便
- 購入試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Metabolomics
- 対象領域
- N/A
- 試料の処理
- CE-TOFMS 測定用前処理：ヒト糞便試料に対し、内部標準物質を含む超純水溶液を添加し、攪拌及び遠心をした。上清を限外ろ過処理した後、超純水を加えて撹拌し、測定に供した。
LC-TOFMS 測定用前処理：内部標準物質を含むメタノール溶液を添加して、攪拌及び遠心をした。上清を限外ろ過処理した後、ろ液を乾固させ、50%イソプロパノール水溶液 (v/v)に溶解して測定に供した。 - プラットフォーム
- Agilent LC System equipped with an Agilent 6230 TOFMS
Agilent CE system equipped with an Agilent 6230 TOFMS - 測定条件
- HMT測定メソッドに準拠
- 解析方法
- ノイズの低減・補正：自動積分ソフトウェアのMasterHands ver.2.19.0.2（慶應義塾大学開発）を用いて、質量電荷比（m/z）、ピーク面積値、CE-TOFMS では泳動時間（Migration time: MT）、LC-TOFMS では保持時間（Retention time: RT）を得た。
アノテーション：検出されたピークに対してm/z とMT またはRT の値をもとにHMT 代謝物質ライブラリに登録された全物質との照合、検索を行った。
定量：MasterHands ver.2.19.0.2（慶應義塾大学開発）
定量：標準化合物を用いた1点検量に基づき濃度を算出した。 - 利用ポリシー
- AGD ポリシー (AGDP_000001)