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NBDC グループ共有データベース

現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所(NIG)バイオデータ研究拠点(BSI)ライフサイエンス統合データベース部門(DBCLS)」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

データセット ID

AGDD_000026

データの種類
ショットガンメタゲノム
アクセス制限
Type I
総データ量
3.2 TB
ファイル形式
  • FASTQ
  • FASTA
  • TSV
研究
agd0029
公開日
2026-07-06
更新日
2026-07-06
AGD Study
AGDS_000016

解析手法

ショットガンメタゲノム

試料 / 対象者
糖尿病(ICD10:E10-E14):340症例
入院時の糞便:340検体
退院時の糞便:339検体
長期追跡時時の糞便:50検体(入退院時の50症例を含む)
  • 健康状態
    罹患
  • 対象者数
    340 (人数)
疾患
  • 糖尿病
試料説明
糞便細菌叢から抽出したDNA
  • 組織
    便
購入試料の入手元
N/A
実験方法
Metagenomics
対象領域
N/A
試薬キット
ThruPLEX DNA-Seq Kit
断片化
超音波断片化(Covaris)
プラットフォーム
Illumina MiSeq
リードタイプ
ペアエンド
リード長
150 bp