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NBDC グループ共有データベース

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研究 ID

agd0020-v2リリース情報

最新

研究題目

OMICS解析による呼吸器疾患の病態メカニズムの解明

研究概要

目的
近年、大気汚染や環境変化、さらには平均寿命の延長も一因と考えられる呼吸器系の疾患(肺・縦隔・頭頚部悪性腫瘍、アレルギー性肺疾患、間質性肺疾患、肺障害、慢性閉塞性肺疾患、感染など)への罹患が増加している。呼吸器疾患は生命の危機に直結する場合もあり、そのメカニズムの解明及び診断法・治療法の開発は喫緊の課題である。それぞれの疾患について、例えば肺癌は閉塞性肺疾患や間質性肺疾患などの慢性炎症を基盤として発生することが知られており、独立した疾患というよりも、相互に関連する疾患であることも多い。すなわち、様々な呼吸器系の疾患のメカニズムを多角的な視点から解明していくことが、呼吸器系疾患全体の理解につながると期待される。本研究では、様々な呼吸器疾患の検体を用いたOMICS解析を網羅的に行うことで、呼吸器疾患の本質に迫り、新たな治療法の開発を目指す。
研究方法
全ゲノム解析、全エクソーム解析、発現解析(RNA-seq)、メタゲノム解析、空間トランスクリプトーム解析、空間プロテオミクス解析
対象
慢性閉塞性肺疾患(Chronic Obstructive Pulmonary Disease:COPD)
URL
N/A

データセット

データセット IDデータの種類解析手法アクセス制限公開日
AGDD_000012NGS(WGS)
  • WGS
Type I2023-07-28
AGDD_000013NGS(Exome)
  • Exome
Type I2023-07-28
AGDD_000014NGS(RNA-seq)
  • RNA-seq
Type I2023-07-28
AGDD_000015メタゲノム
  • メタゲノム
Type I2023-07-28
AGDD_000020NGS(Visium Spatial Gene Expression)、病理画像
  • Visium Spatial Gene Expression
Type I2023-07-28
AGDD_000021GeoMx Digital Spatial Profiler、病理画像
  • GeoMx Digital Spatial Profiler
Type I2023-07-28

提供者

研究代表者
遠西 大輔
所属機関
岡山大学病院 ゲノム医療総合推進センター

研究プロジェクト情報

研究プロジェクト名URL
-
N/A

助成金情報

科研費・助成金名研究課題名研究課題番号
日本医療研究開発機構(AMED) ゲノム医療実現バイオバンク利活用プログラム(次世代医療基盤を支えるゲノム・オミックス解析)
COPDの病態解明・新規治療開発のための空間解析を含むマルチオミックスデータベース構築
  • JP21tm0724603
日本医療研究開発機構(AMED) ゲノム医療実現バイオバンク利活用プログラム(次世代医療基盤を支えるゲノム・オミックス解析)
COPDの病態解明・新規治療開発のための空間シングルセル・マルチオミックスデータベース構築
  • JP22tm0724605

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